Japón cuenta con una división administrativa en prefecturas. Entre ellas están el distrito metropolitano de Tokio, la provincia de Hokkaido, dos prefecturas urbanas, Osaka y Kioto y 43 prefecturas rurales. Esta división territorial, llamada Todofuken, fue adoptada por Japón a partir de 1871.
Teniendo en cuenta esto hagamos una profundización en esas prefecturas y cuáles son sus principales núcleos urbanos.
Prefectura de Aichi
- Aisai
- Ama
- Anjō
- Chiryu
- Chita
- Gamagōri
- Handa
- Hekinan
- Ichinomiya
- Inazawa
- Inuyama
- Iwakura
- Kariya
- Kasugai
- Kitanagoya
- Kiyosu
- Komaki
- Kōnan
- Miyoshi
- Nagoya
- Nisshin
- Okazaki
- Ōbu
- Owariasahi
- Seto
- Shinshiro
- Tahara
- Takahama
- Tokoname
- Tōkai
- Toyoake
- Toyohashi
- Toyokawa
- Toyota
- Tsushima
- Yatom
Prefectura de Akita
- Akita
- Honjo
- Kazuno
- Noshiro
- Oga
- Odate
- Daisen
- Yokote
- Yuzawa
Prefectura de Aomori
- Aomori
- Goshogawara
- Hachinohe
- Hirakawa
- Hirosaki
- Kuroishi
- Misawa
- Mutsu
- Towada
- Tsugaru
Prefectura de Chiba
- Abiko
- Asahi
- Chiba
- Chōshi
- Funabashi
- Futtsu
- Ichihara
- Ichikawa
- Inzai
- Isumi
- Kamagaya
- Kamogawa
- Kashiwa
- Katori
- Katsuura
- Kimitsu
- Kisarazu
- Matsudo
- Minamibōsō
- Mobara
- Nagareyama
- Narashino
- Narita
- Noda
- Sakura
- Sanmu
- Shiroi
- Sodegaura
- Sōsa
- Tateyama
- Tomisato
- Tōgane
- Urayasu
- Yachimata
- Yachiyo
- Yotsukaidō
Perfectura Ehime
- Imabari
- Iyo
- Matsuyama
- Niihama
- Oozu
- Saijo
- Seiyo
- Shikokuchuo
- Toon
- Uwajima
- Yawatahama
Prefectura de Fukui
- Awara
- Echizen
- Eiheiji
- Fukui
- Katsuyama
- Ōno
- Sakai
- Sabae
- Tsuruga
- Obama
Prefectura de Fukuoka
- Asakura
- Buzen
- Chikugo
- Chikushino
- Dazaifu
- Fukuoka
- Iizuka
- Kama
- Kasuga
- Kitakyūshū
- Koga
- Kurume
- Maebaru
- Miyama
- Miyawaka
- Munakata
- Nakama
- Nōgata
- Ogōri
- Ōkawa
- Ōmuta
- Ōnojō
- Tagawa
- Ukiha
- Yame
- Yanagawa
- Yukuhashi
Prefectura de Fukushima
- Aizuwakamatsu
- Date
- Fukushima
- Haramachi
- Iwaki
- Kitakata
- Koriyama
- Minami-sōma
- Motomiya
- Nihonmatsu
- Shirakawa
- Soma
- Sukagawa
- Tamura
Prefectura de Gifu
- Ena
- Gero
- Gifu
- Gujō
- Hashima
- Hida
- Kakamigahara
- Kani
- Kaizu
- Mino
- Minokamo
- Mizuho
- Mizunami
- Motosu
- Nakatsugawa
- Ōgaki
- Seki
- Tajimi
- Takayama
- Toki
- Yamagata
Prefectura de Gunma
- An’naka
- Fujioka
- Isesaki
- Kiryu
- Maebashi
- Numata
- Ota
- Shibukawa
- Takasaki
- Tatebayashi
- Tomioka
- Haruna
Prefectura de Hiroshima
- Akitakata
- Etajima
- Fuchū
- Fukuyama
- Hatsukaichi
- Higashihiroshima
- Hiroshima
- Kure
- Mihara
- Miyoshi
- Onomichi
- Ōtake
- Shōbara
- Takehara
Provincia de Hokkaidō
- Hakodate
- Hokuto
- Ishikari
- Noboribetsu
- Otaru
- Sapporo
- Tomakomai
Prefectura de Hyōgo
- Aioi
- Akashi
- Ako
- Amagasaki
- Asagó
- Ashiya
- Auadyi
- Himeji
- Itami
- Kakogawa
- Kasai
- Kawanishi
- Kōbe
- Miki
- Minami-Auadyi
- Nishinomiya
- Nishiwaki
- Ono
- Sanda
- Sasayama
- Siso
- Sumoto
- Takarazuka
- Takasago
- Tamba
- Tatsuno
- Toyooka
- Yabu
Prefectura de Ibaraki
- Bando
- Chikusei
- Hitachi
- Hitachinaka
- Hitachiota
- Hitachi-omiya
- Hokota
- Inashiki
- Ishioaka
- Itako
- Joso
- Kamisu
- Kasama
- Kashima
- Kasumigaura
- Kitaibaraki
- Koga
- Mito
- Moriya
- Namegata
- Naka
- Omitama
- Ryugasaki
- Sakuragawa
- Shimotsuma
- Takahagi
- Toride
- Tsuchiura
- Tsukuba
- Tsukubamirai
- Ushiku
- Yuki
Prefectura de Ishikawa
- Hakui
- Kaga
- Kanazawa
- Komatsu
- Matto
- Nanao
- Suzu
- Wajima
Prefectura de Iwate
- Esashi
- Hanamaki
- Hachimantai
- Ichinoseki
- Kamaishi
- Kitakami
- Kuji
- Miyako
- Mizusawa
- Morioka
- Ninohe
- Ofunato
- Ōshū
- Rikuzentakata
- Tono
Prefectura de Kagawa
- Higashikagawa
- Kan’onji
- Marugame
- Mitoyo
- Sakaide
- Sanuki
- Takamatsu
- Zentsuji
Prefectura de Kagoshima
- Akune
- Ibusuki
- Izumi
- Kagoshima
- Kanoya
- Kaseda
- Kokubu
- Kushikino
- Makurazaki
- Naze
- Nishinoomote
- Okuchi
- Sendai
- Tarumizu
Prefectura de Kanagawa
Prefectura de Kioto
- Ayabe
- Fukuchiyama
- Jōyō
- Kameoka
- Kizugawa
- Kyōtanabe
- Kyōtango
- Kioto
- Maizuru
- Miyazu
- Mukō
- Nagaokakyō
- Nantan
- Uji
- Yawata
Prefectura de Kōchi
- Aki
- Kochi
- Muroto
- Nakamura
- Nankoku
- Sukumo
- Susaki
- Tosa
- Tosashimizu
Prefectura de Kumamoto
- Amakusa
- Arao
- Aso
- Hitoyoshi
- Kami-Amakusa
- Kikuchi
- Kōshi
- Kumamoto
- Minamata
- Tamana
- Uki
- Uto
- Yamaga
- Yatsushiro
Prefectura de Mie
- Inabe
- Ise
- Iga
- Kameyama
- Kumano
- Kuwana
- Matsusaka
- Nabari
- Owase
- Shima
- Suzuka
- Toba
- Tsu
- Yokkaichi
Prefectura de Miyagi
- Higashimatsushima
- Ishinomaki
- Iwanuma
- Kakuda
- Kesennuma
- Kurihara
- Natori
- Ōsaki
- Sendai
- Shiogama
- Shiroishi
- Tagajō
- Tome
Prefectura de Miyazaki
- Ebino
- Hyuga
- Kobayashi
- Kushima
- Miyakonojo
- Miyazaki
- Nichinan
- Nobeoka
- Saito
Prefectura de Nagano
Prefectura de Nagasaki
- Goto
- Hirado
- Iki
- Isahaya
- Matsuura
- Minamishimabara
- Nagasaki
- Omura
- Saikai
- Sasebo
- Shimabara
- Tsushima
- Unzen
Prefectura de Nara
- Gojo
- Gose
- Ikoma
- Kashihara
- Kashiba
- Katsuragi
- Nara
- Sakurai
- Tenri
- Uda
- Yamatokoriyama
- Yamatotakada
Prefectura de Niigata
- Agano
- Gosen
- Itoigawa
- Jōetsu
- Kamo
- Kashiwazaki
- Minamiuonuma
- Mitsuke
- Murakami
- Myōkō
- Nagaoka
- Niigata
- Ojiya
- Sado
- Sanjō
- Shibata
- Tainai
- Tōkamachi
- Tsubame
- Uonuma
Prefectura de Ōita
- Beppu
- Bungotakada
- Hita
- Kitsuki
- Nakatsu
- Ōita
- Saiki
- Taketa
- Tsukumi
- Usa
- Usuki
Prefectura de Okayama
- Akaiwa
- Asakuchi
- Bizen
- Ibara
- Kasaoka
- Kurashiki
- Maniwa
- Mimasaka
- Niimi
- Okayama
- Setouchi
- Sōja
- Takahashi
- Tamano
- Tsuyama
Prefectura de Okinawa
- Ginowan
- Ishigaki
- Itoman
- Miyakojima
- Nago
- Naha
- Nanjō
- Okinawa
- Tomigusuku
- Urasoe
- Uruma
Prefectura de Osaka
- Daitō
- Fujiidera
- Habikino
- Hannan
- Higashiosaka
- Hirakata
- Ibaraki
- Ikeda
- Izumi
- Izumiotsu
- Izumisano
- Kadoma
- Kaizuka
- Kashiwara
- Katano
- Kawachinagano
- Kishiwada
- Matsubara
- Minoo
- Moriguchi
- Neyagawa
- Osaka
- Osakasayama
- Sakai
- Sennan
- Settsu
- Shijonawate
- Suita
- Takaishi
- Takatsuki
- Tondabayashi
- Toyonaka
- Yao
Prefectura de Saga
- Imari
- Kanzaki
- Karatsu
- Kashima
- Ogi
- Saga
- Takeo
- Taku
- Tosu
- Ureshino
Prefectura de Saitama
- Ageo
- Asaka
- Chichibu
- Fujimi
- Fukaya
- Gyôda
- Hannô
- Hanyû
- Hasuda
- Hatogaya
- Hidaka
- Higashimatsuyama
- Honjô
- Iruma
- Iwatsuki
- Kamifukuoka
- Kasukabe
- Kawagoe
- Kawaguchi
- Kazo
- Kitamoto
- Koshigaya
- Kônosu
- Kuki
- Kumagaya
- Misato
- Niiza
- Okegawa
- Saitama
- Sakado
- Satte
- Sayama
- Shiki
- Sôka
- Toda
- Tokorozawa
- Tsurugashima
- Wakô
- Warabi
- Yashio
- Yoshikawa
Prefectura de Shiga
- Higashi-ōmi
- Hikone
- Kōga
- Konan
- Kusatsu
- Maibara
- Moriyama
- Nagahama
- Otsu
- Ōmihachiman
- Rittō
- Takashima
- Yasu
Prefectura de Shimane
- Gōtsu
- Hamada
- Izumo
- Masuda
- Matsue
- Ōda
- Unnan
- Yasugi
Prefectura de Shizuoka
- Atami
- Fuji
- Fujieda
- Fujinomiya
- Fukuroi
- Gotenba
- Hamakita
- Hamamatsu
- Itō
- Izu
- Izunokuni
- Iwata
- Kakegawa
- Kikugawa
- Kosai
- Makinohara
- Mishima
- Numazu
- Omaezaki
- Shimada
- Shimoda
- Shizuoka
- Susono
- Tenryuu
- Yaidu
Prefectura de Tochigi
- Ashikaga
- Kanuma
- Kuroiso
- Mooka
- Nasukarasuyama
- Nikko
- Otawara
- Oyama
- Sano
- Sakura
- Shimotsuke
- Tochigi
- Utsunomiya
- Yaita
Prefectura de Tokushima
- Naruto
- Tokushima
Prefectura de Tottori
- Kurayoshi
- Sakaiminato
- Tottori
Prefectura de Toyama
- Namerikawa
- Nanto
- Oyabe
- Takaoka
- Tonami
- Toyama
Prefectura de Wakayama
- Arida
- Gobo
- Hashimoto
- Kainan
- Shingū
- Shirahama
- Tanabe
- Wakayama
Prefectura de Yamagata
- Obanazawa
- Sagae
- Sakata
- Shinjo
- Tendo
- Tsuruoka
- Yamagata
Prefectura de Yamaguchi
- Hagi
- Hikari
- Hofu
- Iwakuni
- Kudamatsu
- Mine
- Nagato
- San’yo-onoda
- Shimonoseki
- Shunan
- Ube
- Yamaguchi
Prefectura de Yamanashi
- Chūō
- Enzan
- Fujiyoshida
- Fuefuki
- Hokuto
- Kai
- Kōfu